Совет формируется из руководителей соответствующих органов и организаций государств-участников СНГ, отвечающих за карантин растений.
При направлении на заседания Совета лиц, замещающих членов Совета, их полномочия должны быть подтверждены.
В состав Совета с правом совещательного голоса могут входить руководитель секретариата Совета и представители Исполнительного комитета СНГ.